En la naturaleza existen ciertas proteínas que presentan patrones estructurales recurrentes. De acuerdo al largo de la mínima unidad de repetición pueden ser clasificadas en fibrilares y repetitivas. Las repetitivas, a pesar de ser muy similares a nivel de estructura terciaria, pueden tener repeticiones extremadamente variables a nivel de estructura primaria.
Trabajos previos han utilizado una definición matemática de repetición (repetición maximal) para estudiar la existencia de estos patrones en el contexto de la familia de proteínas Ankyrin. En el presente trabajo, empleamos una técnica de aprendizaje automático -el análisis de reglas de asociación-, para tratar de entender la relación de co-ocurrencia entre dichos patrones. Como resultado se obtuvieron alrededor de 400 reglas de asociación compuestas por 100 patrones distintos.
Un estudio de ocurrencias consecutivas de dichos patrones dentro de cada proteína permitió observar que se repiten a 33 aminoácidos de separación. Esto tiene una estrecha relación con resultados publicados en bibliografía a partir de datos sobre estructura terciaria. Sin embargo, en el presente trabajo, dichos resultados se obtuvieron a partir de datos obtenidos de estructura primaria. Como resultado adicional de este trabajo, se desarrolló una herramienta denominada Protein Rule Visualization Tool, que permite visualizar los datos obtenidos en las distintas etapas del trabajo, de forma simple e intuitiva.