Director: Gabriel Wainer
Jurados: Rodrigo Castro y Pablo Turjanski

Resumen
El modelado nos permite concentrarnos en los componentes que nos resultan más importantes de los fenómenos que estudiamos, dejando de lado aquellos aspectos que no aportan información relevante. Para estudiar redes metabólicas, tenemos primero que crear un modelo nuevo de la red para luego empezar a correr simulaciones y obtener resultados. Un problema importante en el área del modelado y simulación de células biológicas es la falta de generalización de los modelos propuestos, cada modelo es creado para estudiar un aspecto específico de la célula biológica o para estudiar una célula biológica en particular. Debido a esto, es difícil reutilizar dichos modelos. En este trabajo de tesis aplicamos algunos conceptos computacionales como la modularización e integración de modelos para mejorar la automatización e integración de modelos biológicos. Proponemos un modelo general de la estructura de una célula biológica que puede ser usada de framework donde diferentes modelos pueden ser integrados. También proponemos un modelo estocástico a micro escala de la red metabólica de una célula que es general y puede ser automáticamente reutilizada para estudiar redes metabólicas de distintas células biológicas. Debido a que un modelo de red metabólica a micro escala cuenta con miles de modelos atómicos idénticos, introducimos en este trabajo el concepto de multi-state models, que permite la unificación de múltiples modelos atómicos idénticos en uno solo. Finalmente, proponemos un método para el modelado y simulación automático utilizando como input archivos SBML y una plataforma web que permite la utilización remota del sistema implementado, esperando mejorar la colaboración entre distintos grupos de investigación al proponer el modelado y simulación como un servicio.