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SUMMARY:La ciencia al desnudo. Cómo informar en tiempos de incertidumbre
DESCRIPTION:Los invitamos a la próxima charla del seminario a cargo de Nora Bar\, una de las principales periodistas de Argentina especializada en temas vinculados a la ciencia y la salud. \n\n\nCuándo: Jueves 17/9 11AM\nQuién: Nora Bar\nLink zoom:  https://exactas-uba.zoom.us/j/94443673957\nTambién lo podes ver en youtube acá:\nhttps://www.youtube.com/channel/UCzcbeaNQEIhOFBRBdYx1NEA\n\n\nTítulo: «La ciencia al desnudo. Cómo informar en tiempos de incertidumbre». \n\nResumen: Hallazgos preliminares\, fake news\, evidencias endebles\, controversias\, estadísticas sesgadas\, gurúes que se creen iluminados e hipótesis conspiranoicas son algunos de los desafíos que tenemos que enfrentar los periodistas que informamos sobre temas de ciencia y salud\, y que se multiplican en esta pandemia. Salir indemne es casi una misión imposible.\n\nNora Bär es editora y columnista de Ciencia y Salud de La Nación desde hace casi tres décadas. Además\, es conductora del programa semanal «El Arcón\, ciencia\, salud y tecnología» (www.radiotrendtopic.com.ar); columnista de «Pasaron Cosas» (Radio con Vos)\, y autora de «Diez preguntas que la ciencia (todavía) no puede contestar» (Editorial Paidós) y «Rebelión en el laboratorio. Vidas de mujeres científicas» (Editorial Planeta). También coordina desde hace siete años el Café Científico de la Academia Nacional de Ciencias Exactas\, Físicas y Naturales. Actualmente\, es presidenta de la Red Argentina de Periodistas Científicos.
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SUMMARY:El aporte de los Institutos de Cálculo y de Ciencias de la Computación de la UBA en el contexto del Covid-19
DESCRIPTION:Los invitamos a la próxima charla del seminario a cargo de Nora Bar\, una de las principales periodistas de Argentina especializada en temas vinculados a la ciencia y la salud.\n\nCuándo: Jueves 24/9 11AM\nQuién: Guillermo Durán (Director del Instituto de Cálculo FCEN-UBA/CONICET)\nLink zoom:  https://exactas-uba.zoom.us/j/94443673957\nTambién lo podes ver en youtube acá:\nhttps://www.youtube.com/channel/UCzcbeaNQEIhOFBRBdYx1NEA\n\n  \nTítulo: El aporte de los Institutos de Cálculo y de Ciencias de la Computación de la UBA en el contexto del Covid-19 \nResumen: Con la llegada de la pandemia a la Argentina allá por inicios de marzo de este año\, los Institutos de Cálculo y de Ciencias de la Computación\, ambos FCEN-UBA/CONICET\, decidimos asociarnos y poner toda nuestra potencialidad al servicio del estudio cuantitativo relacionado con el Covid-19. Análisis de datos en Argentina y el mundo\, simulación de escenarios y trabajo concreto en terreno de apoyo a diversas jurisdicciones del país fueron parte de nuestro trabajo cotidiano. Con el paso del tiempo\, algunos de nosotros nos integramos al comité de asesores científicos del gobernador Kicillof y buena parte de nuestra tarea se centró en temas vinculados al combate a la pandemia en el ámbito de la Provincia de Buenos Aires.\nEn esta charla haremos una reseña de las actividades de los 2 Institutos en apoyo a la Provincia y evaluaremos la situación actual de la pandemia en Argentina y el mundo. \nGuillermo Durán es Dr. en Cs de la Computación y Licenciado en Matemática de la FCEN-UBA.\nDirector del Instituto de Cálculo UBA/CONICET.\nProfesor Asociado en el Departamento de Matemática de la FCEN-UBA\nInvestigador Principal del CONICET.\nEs miembro del comité de asesores científicos del gobernador de la Pcia de Buenos Aires en temas de Covid-19 y Coordinador General (ad-honorem) del «Programa de fortalecimiento de la prevención y seguimiento frente al COVID-19» de PBA.
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SUMMARY:Comportamientos sociales en situaciones de ruptura radical de la vida cotidiana
DESCRIPTION:Los invitamos a la próxima charla del seminario a cargo de Daniel Feierstein\, Director del Centro de Estudios sobre Genocidio UNTREF/CONICET.\n\n\nCuándo: Jueves 2/10 11AM\nQuién: Daniel Feierstein (Director del Centro de Estudios sobre Genocidio UNTREF/CONICET\, Profesor Titular UBA)\nLink zoom:  https://exactas-uba.zoom.us/j/94443673957\nTambién lo podes ver en youtube acá:\nhttps://www.youtube.com/channel/UCzcbeaNQEIhOFBRBdYx1NEA\n\n\n\nTítulo: Comportamientos sociales en situaciones de ruptura radical de la vida cotidiana\n\nResumen:  Las pandemias constituyen procesos eminentemente sociales\, dado que afectan y se ven determinados por los comportamientos sociales. Paradójicamente\, al tratarse de fenómenos que involucran una dimensión biológica y médica\, esta verdad evidente suele ignorarse. Es así como se asumen gran cantidad de percepciones erróneas acerca de los comportamientos sociales llevando al fracaso de las medidas sanitarias\, dada la dificultad para comprender el rol de conocimientos anti-intuitivos.\nEn esta charla se buscará dar cuenta de los modos de comprender la asignación de sentido en la acción social\, sus componentes racionales y afectivos\, los modos de construcción de nuestra representación de los hechos sociales y algunas de sus formas de expresión ante la ruptura de la vida cotidiana generada por la irrupción del COVID 19\, incluyendo el rol del miedo\, el negacionismo\, la naturalización\, la neutralización\, la proyección\, las lógicas agonales\, entre otras). \nDaniel Feierstein es Dr. en Ciencias Sociales y Licenciado en Sociología por la Universidad de Buenos Aires. Director del Centro de Estudios sobre Genocidio en UNTREF y del Observatorio de Crímenes de Estado en FSOC\, UBA.\nProfesor Titular en UNTREF y en FSOC UBA e Investigador del CONICET.\nDirige el Equipo de Asistencia Sociológica a Querellas que ha colaborado con el proceso de juzgamiento a genocidas en Argentina\, Bangladesh\, Camboya\, Colombia\, Chile y México. Fue Presidente de la Asociación Internacional de Investigadores sobre Genocidio (2013-2015)\, es Juez del Tribunal Permanente de los Pueblos y fue Consultor de Naciones Unidas.
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SUMMARY:Los modos de transmisión del SARS-CoV-2 y cómo protegernos: lo que sabemos ahora
DESCRIPTION:Los invitamos a la próxima charla del seminario a cargo de Jose Luis Jiménez\, de la Universidad de Colorado.\n\nCuándo: Jueves 8/10 11AM\nQuién: Jose Luis Jiménez\, (Universidad de Colorado).\nLink zoom:  https://exactas-uba.zoom.us/j/94443673957\nTambién lo podes ver en youtube acá:\nhttps://www.youtube.com/channel/UCzcbeaNQEIhOFBRBdYx1NEA\n\n\nTítulo: Los modos de transmisión del SARS-CoV-2 y cómo protegernos: lo que sabemos ahora\n\nResumen: En esta charla presentaré la importancia de los aerosoles en la transmisión de enfermedades\, un tema en el que he estado trabajando junto a líderes mundiales desde marzo de 2020. Resumiré las razones por las que muchos científicos pensamos que la transmisión de COVID-19 está dominada por aerosoles\, con una fracción menor de transmisión por superficies\, y con una fracción pequeña de gotitas balísticas (sólo importante al toser y estornudar). Explicaré las raíces de la extremada resistencia de la OMS a la transmisión por aerosoles\, que tiene su origen en un siglo de negación del papel de los aerosoles en la transmisión de enfermedades. Presentaré algunas ideas sobre cómo protegernos mejor de COVID-19 en los próximos meses y de otras enfermedades respiratorias en el futuro. \nJosé Luis Jiménez es Profesor en la Universidad de Colorado y se especializa en química atmosférica\, mediciones de campo\, espectrometría de masas de aerosoles y desarrollo de instrumentos avanzados. Hizo su doctorado en el Instituto de Tecnología de Massachusetts. Ha sido receptor de numerosos reconocimientos por su trabajo siendo el quinto científico más citado en el mundo en geociencias.
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SUMMARY:Metodologías para la inactivación y preparación de muestras para la detección del genoma del SARS-CoV-2 por métodos comerciales y "caseros"
DESCRIPTION:Los invitamos a la próxima charla del seminario a cargo de Ezequiel Petrillo \, de la FCEN-UBA.\n\nCuándo: Jueves 15/10 11AM\nQuién: Ezequiel Petrillo\nLink zoom:  https://exactas-uba.zoom.us/j/94443673957\nTambién lo podes ver en youtube acá:\nhttps://www.youtube.com/channel/UCzcbeaNQEIhOFBRBdYx1NEA\n\n\nTítulo: Metodologías para la inactivación y preparación de muestras para la detección del genoma del SARS-CoV-2 por métodos comerciales y «caseros»\nResumen: Optimización de diferentes aspectos del método de diagnóstico de COVID-19\, cuyo agente etiológico es el SARS-CoV-2\, basado en la preparación de ARN seguido por RT-qPCR o métodos isotérmicos. Contemplamos una posible intervención en todos los pasos necesarios del protocolo de detección del virus\, buscando abaratar costos y extendiendo las capacidades de diagnóstico en el país\, haciendo eje en la inactivación temprana de las muestras clínicas y en un método de qPCR más flexible.\nDiscutiremos los avances realizados en el marco de este proyecto\, y las ventajas y desventajas de las metodologías de preparación de muestras y diagnóstico que hemos optimizado. \nEzequiel Petrillo es Dr. en Cs Biológicas de la FCEN-UBA. Investigador Adjunto y Jefe de Grupo del Instituto de Fisiología\, Biología Molecular y Neurociencias (IFIBYNE) – CONICET-UBA. Su laboratorio estudia las respuestas de las plantas a la luz a nivel de la expresión de sus genes\, pero durante la pandemia\, junto a otros grupos con objetos de estudio similares\, se han dedicado a desarrollar metodologías para facilitar el diagnóstico de COVID-19 en el marco de un Idea Proyecto de la ANPCYT del cual es coordinador y en el que el Investigador Responsable es el Dr. Alberto Kornblihtt.
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SUMMARY:Llegada a terreno de un aporte científico argentino: La experiencia de Neokit
DESCRIPTION:Los invitamos a la próxima charla del seminario a cargo de Jorge Cassará que hablará de la experiencia del desarrollo del Neokit\n\nExponen: Jorge Cassará (Lic. en Cs. Químicas\, FCEN-UBA)\, Sergio Pallotto (Farmacéutico\, UBA)\nCuándo: Jueves 22/10 11AM\n\n\nLink zoom:  https://exactas-uba.zoom.us/j/94443673957\nTambién lo podes ver en youtube acá:\nhttps://www.youtube.com/channel/UCzcbeaNQEIhOFBRBdYx1NEA\n\n\n\nTítulo: Llegada a terreno de un aporte científico argentino: La experiencia de Neokit\n\nResumen: El objetivo es compartir una experiencia sobre lo que ocurre luego de que un desarrollo de la ciencia argentina pasa del paper o prototipo\, a un producto concreto\, disponible\, accesible y con alto impacto social en el campo de la salud humana en el marco de una pandemia global. Se describirán el desarrollo de Neokit\, el modelo de negocios asociativo con los investigadores\, los requisitos regulatorios\, la puesta en planta\, la experiencia de campo en la implementación de la solución\, y la situación actual de aprovechamiento del aporte científico argentino por el sistema de salud.\n\nJorge Cassará es Lic. en Ciencias Químicas de la FCEN-UBA. Es director comercial en Laboratorio Pablo Cassará y administrador en Neokit SAS.\nSergio Pallotto es Farmacéutico de la UBA. Es Director Técnico de Neokit SAS.
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SUMMARY:Algunas contribuciones estadísticas para el análisis de los datos del COVID 19
DESCRIPTION:Los invitamos a la próxima charla del seminario a cargo de Ana Bianco\, Guillermo Solovey y Marina Valdora del Instituto del Cálculo.\n\nExponen: Ana Bianco\, Guillermo Solovey y Marina Valdora del Instituto del Cálculo.\nCuándo: Jueves 29/10 11AM\n\n\nLink zoom:  https://exactas-uba.zoom.us/j/94443673957\nTambién lo podes ver en youtube acá:\nhttps://www.youtube.com/channel/UCzcbeaNQEIhOFBRBdYx1NEA\n\n\n\nTítulo: Algunas contribuciones estadísticas para el análisis de los datos del COVID 19\n\nResumen: En esta charla presentaremos algunas contribuciones estadísticas para la comprensión de los datos de COVID-19 en Argentina. Presentaremos algunas herramientas desarrolladas por el grupo de estadística convocado por el Instituto de Cálculo que permiten visualizar\, de forma actualizada\, diferentes datos públicos de COVID-19 publicados por Ministerio de Salud de la Nación. En particular\, mostraremos una aplicación que permite calcular tiempos de duplicación. Por último\, presentaremos una estimación\, basada en datos de la provincia de Buenos Aires\, de la probabilidad de requerir internación en UCI a partir de un análisis de comorbilidades. \nAna M. Bianco. Doctora en Ciencias Matemáticas\, UBA\, Profesora Titular del Instituto de Cálculo\, FCEN\, UBA e Investigadora Independiente del CONICET en el Instituto de Cálculo (UBA – CONICET)\nGuillermo Solovey. Doctor en Física (UBA). Profesor Adjunto de la FCEN (UBA) e Investigador Adjunto del CONICET en el Instituto de Cálculo (UBA-CONICET)\nMarina Valdora. Doctora de la UBA\, Profesora Adjunta del Departamento de Matemática\, FCEN\, UBA e Investigadora Asistente del CONICET en el Instituto de Cálculo (UBA-CONICET).
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SUMMARY:Defensa Tesis Licenciatura Federico De Rocco
DESCRIPTION:Título: Slicing Dinámico para Lenguajes de la Familia .NET\nDirector: Alexis Soifer\nJurados: Victor Braberman y Leandro Nahabedian\n\nResumen:\nSlicing dinámico es una técnica que entre otras virtudes permite simplificar la tarea de debugging encontrando aquellas líneas relevantes para un comportamiento dado. Para construir este slice el enfoque tradicional se basa en la búsqueda de dependencias entre las instrucciones del programa analizando información obtenida de la ejecución del programa bajo análisis.\nEl grupo LaFHIS desarrolló en los últimos años DynAbs\, un slicer de emisión/análisis de traza destinado a analizar código de alto nivel que intenta atacar parcialmente problemas de escalabilidad existentes en este tipo de herramientas para aplicaciones C#.\nA pesar de los avances\, DynAbs no ataca una de las deficiencias que tienen las herramientas de este tipo\, que es la limitación de tratar un único lenguaje. \nEn este trabajo se presenta una extensión de la herramienta para operar sobre el lenguaje Visual Basic. Como otros slicers de análisis de traza\, estos están constituidos por una parte destinada a instrumentar el código cliente y otra a consumir la traza generada en su ejecución. \nPor lo tanto este trabajo consistió en implementar por un lado la funcionalidad necesaria para instrumentar código Visual Basic\, y por otro\, abstraer el módulo de análisis para que trate ambos lenguajes.
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SUMMARY:Nueva Charla sobre la Licenciatura en Ciencias de Datos
DESCRIPTION:El próximo lunes 2 de noviembre\, tendremos la segunda charla sobre LCD\, la carrera impulsada por los departamentos de Matemática\, Física y Computación\, y por el Instituto de Cálculo\, que se aprobó hace pocos meses en el Consejo Superior de la UBA.\n\n\nEs una muy buena oportunidad para sacarte todas las dudas antes de inscribirte.\n\n\n Inscribite desde https://exactas.uba.ar/extension/ov/#menu-4
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SUMMARY:Detección de SARS-CoV-2 por RT-qPCR sin extracción de RNA:  Desarrollo de un método rápido\, de bajo costo y sin pérdida de sensibilidad
DESCRIPTION:Los invitamos a la próxima charla del seminario a cargo de Valeria Levi y Valeria Genoud\, del Departamento de Química Biológica\, FCEN-UBA).\n\nQuienes: Valeria Levi y Valeria Genoud\, del Departamento de Química Biológica\, FCEN-UBA).\n\n\nCuándo: Jueves 5/11 11AM\n\n\nLink zoom:  https://exactas-uba.zoom.us/j/94443673957\nTambién lo podes ver en youtube acá:\nhttps://www.youtube.com/channel/UCzcbeaNQEIhOFBRBdYx1NEA\n\n\n\nTítulo: Detección de SARS-CoV-2 por RT-qPCR sin extracción de RNA:  Desarrollo de un método rápido\, de bajo costo y sin pérdida de sensibilidad\n\n\nResumen: En este seminario presentaremos un procedimiento que permite eliminar el paso de extracción de ARN viral requerido para la detección de\nSARS-CoV-2 por RT-qPCR\, técnica considerada «estándar de oro» para dicho análisis. Este paso de extracción constituye el cuello de botella en el testeo por ser un procedimiento caro\, muy laborioso y lento.  El método diseñado no introduce pérdida en la sensibilidad y especificidad de la detección. Además\, utiliza insumos locales con un costo diez veces menor al requerido actualmente e incluye un único paso muy sencillo y muy rápido.\n\n\n\nValeria Levi es Investigadora Principal de Conicet y Profesora Adjunta del Depto QB (FCEN-UBA). Valeria Genoud:es Jefe de Trabajos Prácticos (QB-FCEN-UBA)
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SUMMARY:Defensa Tesis Licenciatura Ezequiel Davidovich Caballero
DESCRIPTION:Título: Autómatas para la vinculación parcial de servicios\nFecha y hora: miércoles 11 de noviembre de 2020 a las 1800 hs.\nReunión: https://meet.google.com/bgc-xzyi-thr\nResumen: Los sistemas distribuidos resultantes de paradigmas emergentes como service-oriented computing (SOC) y Cloud/Fog computing están transformando al mundo del software\, impulsando lo que se denomina economía de API. La idea subyacente de economía de API es la posibilidad de construir software componiendo servicios externos y registrados previamente en repositorios. Aplicaciones que corren sobre recursos disponibles a nivel global con una infraestructura de comunicación que se reconfiguran en forma dinámica y transparente\, a través de un middleware dedicado capaz de descubrir y conectarlas a servicios que puedan cumplir determinados requisitos.\n\nEn general los aspectos principales del comportamiento de una API son documentados informalmente limitando la posibilidad de lograr la utopía de SOC: la negociación de servicios en forma automática. Un elemento clave para esto es la existencia de lenguajes formales\, junto con técnicas asociadas de análisis\, capaces de expresar por completo el contrato de comportamiento de una API. Estos formalismos usualmente están definidos de forma que la correctitud se reduce a la ausencia de ciertas configuraciones consideradas erróneas (i.e.\, deadlock\, receptor no especificado\, y mensajes huérfanos)\, que sólo puede ser comprobada con la presencia de todos los participantes involucrados a través de propiedades como Generalized Multiparty Compatibility (GMC).\n\nEn este trabajo nos abocaremos al estudio de: 1) una nueva clase de Communicating Finite State Machines (CFSMs)\, llamada Multichannel Communicating Finite State Machines (mCFSMs)\, que cuenta con una definición explícita de canales de comunicación que permiten\, para un participante\, la posibilidad de tener más de un canal de comunicación con los otros participantes\, 2) una definición de la propiedad de GMC para sistemas de mCFSMs\, 3) una clase de Autómatas Finitos de Comunicación Asincrónica (AFCAs) con la capacidad de internalizar la comunicación entre participantes como operaciones de lectura/escritura en buffers internos\, permitiendo la composición parcial de AFCAs\, y 4) una forma de relacionar un AFCA con su correspondiente mCFSM\, facilitando un mecanismo para comprobar la propiedad de GMC para la clase de AFCAs.\n\nPalabras claves: Autómatas\, Communicating Finite State Machines\, Service-oriented computing\, sesiones multiparticipante.
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SUMMARY:Producción económica y escalable de proteínas para diagnóstico\, tratamiento y prevención de COVID-19
DESCRIPTION:Los invitamos a la próxima charla del seminario a cargo de Alejandro Nadra y Natalia Fernandez del IB3\, FCEN\, UBA y parte del Consorsio antiCovid \n \nQuienes: Natalia Fernández (IB3\, FCEN-UBA)\, Alejandro Nadra (IB3\, FCEN-UBA). Consorcio antiCOVID: CONICET\, FCEN-UBA\n\nCuándo: Jueves 12/11 11AM\n\n\nLink zoom:  https://exactas-uba.zoom.us/j/94443673957\nTambién lo podes ver en youtube acá:\nhttps://www.youtube.com/channel/UCzcbeaNQEIhOFBRBdYx1NEA\n\n\n\nTítulo:  Producción económica y escalable de proteínas para diagnóstico\, tratamiento y prevención de COVID-19 \nResumen:  En el seminario presentaremos el Consorcio antiCOVID y su forma de trabajo\, les contaremos los avances en la producción de una proteína RBD escalable y funcional en un sistema alternativo al de células HEK y cerraremos con ejemplos del uso de estas proteínas en diagnóstico\, tratamiento y prevención de COVID19. El seminario está planteado como una conversación y una invitación a articular y colaborar con otros equipos de trabajo e instituciones en pos de potenciar las herramientas para combatir la pandemia. \n\nExpositores:\nNatalia Fernandez es Becaria posdoctoral CONICET en el IB3\, FCEN\, UBA.\nAlejandro Nadra es Investigador independiente CONICET con lugar de trabajo en el IB3\, FCEN\, UBA y Profesor Adjunto en el FBMC\, FCEN\, UBA.\nExponen en representación del Consorcio antiCOVID: CONICET\, FCEN-UBA (iB3/AGBT-FBMC\,QB\,QO)\, FFyB-UBA\, FI-UBA\, UTN\, Instituto Antártico\, IIB-UNSAM\, ICT- Milstein.
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SUMMARY:10mo TORNEO ARGENTINO DE PROGRAMACIÓN
DESCRIPTION:Sedes: **Virtual**\, Bahía Blanca (UNS)\, Buenos Aires (UBA)\, Chilecito (UNdeC)\, \nCórdoba (UNC)\, Jujuy(UNJu)\, La Plata (UNLP)\, La Rioja (UNLaR) Rosario (UNR)\, Orán (UNS) y Tucumán (UNT) \n\nNota importante sobre versión 2020: A diferencia de otros años\, esta versión del TAP admitirá la participación puramente online. Es decir\, los equipos podrán participar desde cualquier computadora y no necesariamente desde una sede de la competencia. Dada la incertidumbre que tenemos por estas fechas en cuanto a eventos presenciales\, no podemos asegurar que ninguna de las sedes mencionadas pueda llevar a cabo algún tipo de evento que no sea online. De esta manera\, los equipos tienen dos opciones a la hora de la inscripción en cuanto a la sede: \n1) Anotarse en la sede **Virtual** para participar desde donde les sea cómodo. 2) Anotarse en la sede «clásica» que le corresponda. Con el correr de las semanas dicha sede informará si estará en condiciones de hacer algún tipo de evento presencial o no. \n—————————————- \nInformación general: \nEl 14 de noviembre se llevará a cabo la décima edición del Torneo Argentino de Programación\, en el que compiten equipos de 3 estudiantes cada uno de instituciones de educación superior de Argentina. \nEl torneo consiste en resolver un conjunto de problemas algorítmicos en un plazo de 5 horas. La solución a cada problema es un programa que se envía mediante un sistema especial al jurado. El jurado corrige en el momento mediante casos de prueba secretos (test de caja negra) y el equipo se entera al instante si la solución enviada es correcta\, de manera que puede corregirla y reenviarla tantas veces como sea necesario. \nEste torneo se enmarca dentro de la competencia ICPC (The International Collegiate Programming Contest\, http://icpc.baylor.edu/). \nSe entregarán certificados oficiales de la ICPC\, tanto de participación como de posición obtenida. \n\nLas instituciones que así lo deseen (no es obligatorio) pueden usar el torneo para seleccionar sus equipos para la Competencia Regional Latinoamericana 2020. \n\nQUIENES PUEDEN PARTICIPAR \n\nLas condiciones que deben cumplir los alumnos que quieran participar son las mismas de la Competencia Regional Latinoamericana. (https://icpc.global/regionals/rules) \nPueden encontrar información sobre las reglas\, problemas de ediciones anteriores de la Competencia Regional y del Torneo Argentino\, así como otros links de interés en la siguiente página: \nhttp://torneoprogramacion.com.ar/ \nhttps://www.facebook.com/torneoargentinodeprogramacion
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SUMMARY:Defensa Tesis Licenciatura Fernando Gasperi Jabalera
DESCRIPTION:Título: Refactorings Automáticos de Alto Nivel\nEstudiante: Fernando Gasperi Jabalera\nJurados: Emilio Oca y Gabriela Arévalo\nDirector: Hernán Wilkinson\nDía y hora: Martes 17 de Noviembre\, 19 hrs.\nResumen:\nLa investigación sobre refactorings tiene un potencial enorme\, el cual se desprende del hecho de que son técnicas fundamentales para el mantenimiento del software productivo. La automatización de los mismos permite reducir el tiempo de desarrollo y aumentar la calidad del diseño ya que los programadores pueden experimentar de manera más barata. Cuánto del proceso de refactoring automatizar y a qué nivel son preguntas de investigación actual.\nEste trabajo se enfoca en la automatización de refactorings de alto nivel en el entorno de Smalltalk-80 Argentino denominado Cuis. Específicamente en la implementación de dos refactorings: Extract Method To Method Object e Introduce Null Object. Nos apoyamos en las conclusiones de Murphy-Hill\, «»Programmer Friendly Refactoring Tools\,» para guiar el grado de automatización provisto. El objetivo principal es explorar las dificultades y posibilidades de implementar refactorings de tan alto nivel que actualmente no se encuentran en ninguna herramienta de desarrollo comercial.\nLas implementaciones fueron integradas a CuisUniversity y comenzaron a ser usadas por los estudiantes de la materia de Ingeniería de Software 1. Las mismas muestran la viabilidad de la implementación de refactorings de tan alto nivel y la dificultad de presentarle al programador todas las configuraciones necesarias para la aplicación de los mismos.\n 
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SUMMARY:Emergencias virales\, pandemias y vacunas...
DESCRIPTION:Los invitamos a la próxima charla del seminario a cargo de Mario Lozano de UNQ/CONICET. \n \nQuien: Mario Lozano\n\nCuándo: Jueves 19/11 11AM\n\n\nLink zoom:  https://exactas-uba.zoom.us/j/94443673957\nTambién lo podes ver en youtube acá:\nhttps://www.youtube.com/channel/UCzcbeaNQEIhOFBRBdYx1NEA\n\n\n\n\n\nTítulo: Emergencias virales\, pandemias y vacunas… \nResumen: La COVID19 es una enfermedad emergente con capacidad pandémica. Hay razones historicas\, sociales\, culturales y genéticas que nos enfrentan al mundo de la emergencia viral. Entender las razones que subyacen a la aparición de las enfermedades emergentes\, es crucial para diseñar estrategias correctas de control y vigilancia. Entre todas las enfermedades emergentes algunas además poseen potencial pandémico\, la gripe\, el SIDA\, la viruela y la COVID19 entre ellas\, las vacunas son nuestra mejor herramienta para controlarlas. Nunca antes en la historia de la humanidad nos hemos enfocado tanto en su desarrollo como ahora y 10 proyectos están en la última fase de desarrollo. ¿Hay mejores y peores? \nMario Lozano es Dr. en Cs. Bioquímicas por la UNLP\, profesor y ex Rector de la UNQ\, investigador del CONICET. Actualmente es secretario de educación de la municipalidad de Quilmes.
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SUMMARY:Defensa Tesis Doctorado Pablo Barenbaum
DESCRIPTION:Título: Semántica dinámica de cálculos de sustituciones explícitas a distancia \nDirectores: Eduardo Bonelli y Delia Kesner. \nJurados:\nDr. Nazareno Aguirre (Universidad de Río Cuarto y CONICET)\nDr. Zena Ariola (University of Oregon)\nDr. Alexandre Miquel (Universidad de la República / Fing / IMERL) \nResumen:\nLos cálculos de sustituciones explícitas son variantes del cálculo-lambda en los que la operación de sustitución no se define a nivel del metalenguaje\, sino con reglas de reescritura que la implementan. Nuestro principal objeto de estudio es un cálculo de sustituciones explícitas particular\, el Linear Substitution Calculus (LSC)\, definido por Accattoli y Kesner en 2010. Se caracteriza por el hecho de que las reglas de reescritura operan no localmente (a distancia). En esta tesis\, en primer lugar\, definimos máquinas abstractas que implementan estrategias de evaluación en el LSC: call-by-name para evaluación débil y fuerte\, call-by-value y call-by-need. Demostramos que dichas máquinas son correctas y preservan la complejidad temporal. En segundo lugar\, definimos una extensión de la estrategia de evaluación call-by-need en el LSC para evaluación fuerte. Demostramos que la estrategia es completa con respecto a call-by-name\, usando un sistema de tipos intersección no idempotente\, y mostramos cómo extenderla para lidiar con pattern matching y recursión. Por último\, estudiamos la teoría de residuos y familias de radicales en el LSC. Para ello definimos una variante del LSC con etiquetas de Lévy\, lo que nos permite demostrar que cumple con la propiedad de Finite Family Developments. Aplicamos esta propiedad para obtener resultados de optimalidad\, estandarización y normalización de estrategias en el LSC\, y generalizamos algunos de estos resultados al marco axiomático de Deterministic Family Structures.
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SUMMARY:Detección de la presencia de material genético de SARS CoV 2 en aguas residuales de la Provincia de Buenos Aires.
DESCRIPTION:Los invitamos a la próxima charla del seminario a cargo de Juan Manuel Carballeda de CONICET/UNQ.\n\n\nQuien:Juan Manuel Carballeda (Investigador del Conicet\, Universidad Nacional de Quilmes)\n\n\nCuándo: Jueves 26/11 11AM\n\n\nLink zoom:  https://exactas-uba.zoom.us/j/94443673957\nTambién lo podes ver en youtube acá:\nhttps://www.youtube.com/channel/UCzcbeaNQEIhOFBRBdYx1NEA\n\n\n\nTítulo: Detección de la presencia de material genético de SARS CoV 2 en aguas residuales de la Provincia de Buenos Aires.\nLa epidemiología basada en aguas residuales es una herramienta que busca obtener información en tiempo real acerca de la presencia de agentes químicos y biológicos en el agua residual de determinada comunidad.\nPoco tiempo después de comenzada la pandemia de Covid19 aparecieron reportes de trazas de ARN viral en aguas residuales en distintas ciudades. En todos los casos se trataban comunidades conectadas completamente a redes cloacales.\nEn el presente trabajo intentamos aplicar esta metodología en barrios populares cuyas redes cloacales no cubren a la totalidad de la población. Constituye el primer trabajo completado en el país de análisis de la presencia de genoma de SARS CoV 2 en aguas residuales.\nFue realizado en coordinación con el Organismo Provincial para el Desarrollo Sostenible de la Provincia de Buenos Aires\, OPISU y la Universidad Nacional de Quilmes con el apoyo del Ministerio de Ciencia\, Tecnología e Innovación Productiva de la Nación y el Ministerio de Salud de la Provincia de Buenos Aires. \n\nJuan Manuel Carballeda es Biólogo y Doctor en el área Ciencias Biológicas de la Facultad de Ciencias Exactas de la UBA e investigador asistente de CONICET. Trabaja actualmente en el estudio de la replicación del virus de la Encefalitis de Saint Louis en el Laboratorio de Virus Emergentes de la Universidad Nacional de Quilmes. Es docente en el FBMC de la FCEN-UBA\, la UNQ y la UNM y realiza actividades de difusión pública de la ciencia en diferentes medios. \n\nPodes ver todas las charlas acá \n\nLes esperamos!
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SUMMARY:Defensa Tesis Licenciatura Agustín Garassino
DESCRIPTION:Título: Un estudio empírico comparativo sobre modelos de elección discreta. \nDirectores: Gerardo Berbeglia (MBS\, University of Melbourne)\, Gustavo Vulcano (UTDT) \nJurado: Juan José Miranbda Bront (UTDT) y Diego Fernández Slezak (UBA) \nJoin Zoom Meeting \nhttps://utdt.zoom.us/j/97608114345 \nMeeting ID: 976 0811 4345 \nResumen: La estimación de demanda es una tarea fundamental en gestión de operaciones y revenue management\, brindando los datos necesarios para control de inventario\, diseño de surtidos y modelos de pricing. La tarea es particularmente difícil en contextos operativos donde la disponibilidad de los productos varía a lo largo del tiempo\, induciendo la sustitución por parte de los consumidores. Además del clásico modelo multinomial logit (MNL) y sus extensiones (ej: nested logit\, mixed MNL)\, nuevos modelos de demanda fueron propuestos (ej: modelo de Markov Chain) y otros fueron recientemente revisitados (ej: el ranked-list y el exponomial). Al mismo tiempo\, nuevos algoritmos fueron desarrollados para facilitar su estimación (ej: generación de columnas\, expectation-maximization). En este trabajo se realizó un estudio sistemático y empírico de múltiples modelos de demanda basados en elección discreta\, y de distintos algoritmos de estimación\, incluyendo máxima verosimilitud y cuadrados mínimos. Con un exhaustivo conjunto de experimentos numéricos sobre datos sintéticos\, semi-sintéticos y reales\, se proveen estadísticas comparativas del poder predictivo y la performance económica de una amplia colección de modelos. A su vez se caracterizaron los entornos operativos adecuados para su implementación. Adicionalmente\, se realizó un resumen de todos los modelos evaluados.
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SUMMARY:Defensa Tesis Licenciatura Matias Dinota
DESCRIPTION:Título: TDDGuru: una herramienta para el aprendizaje de TDD en Smalltalk\nDirector: Hernán Wilkinson\nJurados: Juan Pablo Galeotti y Martín Urtasum\n\nDía y hora: Viernes 27 de Noviembre\, 19 hrs.\nResumen:\nTest Driven Development (de ahora en adelante TDD) es un proceso de desarrollo de software que surge en la década del 2000 y fue tomando relevancia con el correr de los años tanto en el ámbito comercial como en el académico.\nEl presente trabajo describe la implementación de una herramienta —TDDGuru— para asistir en el aprendizaje a quienes están iniciándose en TDD. Fue desarrollada en CuisUniversity\, una distribución del Smalltalk open-source argentino denominado Cuis\, que actualmente se utiliza para la enseñanza universitaria de Programación Orientada a Objetos e Ingeniería de Software. Esta herramienta analiza el historial de cambios realizados por el programador (log) para determinar si este respetó las prácticas de TDD y\, en caso contrario\, informar los errores que se cometieron. Al utilizar el log de cambios\, el análisis no es intrusivo —permite que el usuario desarrolle con normalidad— y se realiza una vez terminada una parte o la totalidad de la implementación.\nAdemás de los detalles en la implementación de TDDGuru\, en el trabajo se muestran las extensiones que se hicieron a CuisUniversity para lograr tener un análisis completo de todas las acciones del usuario. Se detallan también las modificaciones realizadas al modelo de cambios de Cuis\, algunas de las cuales fueron incorporadas a la imagen base del sistema.\nPor último\, se describen las pruebas de uso real de la primera versión de la herramienta en el ambiente universitario. Las mismas permitieron hacer ajustes sobre TDDGuru y proporcionaron ideas para futuros cambios e investigaciones sobre la eficacia de la herramienta.
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SUMMARY:Argentina y la pandemia. Buscando las causas de una estrategia fallida
DESCRIPTION:Los invitamos a la próxima charla del seminario a cargo de Juan Flo\, de FCEN-UBA.\n\nQuien: Juan Flo  (FCEN-UBA)\n\n\nCuándo: Jueves 3/12 11AM\n\n\nLink zoom:  https://exactas-uba.zoom.us/j/94443673957\nTambién lo podes ver en youtube acá:\nhttps://www.youtube.com/channel/UCzcbeaNQEIhOFBRBdYx1NEA\n\n\n\n\nTítulo: Argentina y la pandemia. Buscando las causas de una estrategia fallida\nResumen: Previamente a la pandemia que nos azota\, en el siglo XX y lo que va del XXI la humanidad ha pasado por 4 pandemias. Tres de ellas en el siglo XX (1918\, 1957\, 1969) y una en el siglo XXI (2009).\nSin embargo\, al momento de enfrentar la pandemia de la Covid 19 y decidir que medidas tomar\, esos antecedentes no fueron tenidos en cuenta en casi ningún lugar.\nEl abordaje de las mismas por los gobiernos a lo largo de la historia ha tenido puntos en común que se han repetido en la actual pandemia. La minimización de las pandemias ha sido una característica recurrente\, así como la falta de participación de las diferentes disciplinas científicas.\nLa pandemia del 2009 pudo haber sido una experiencia muy útil para prepararse. Sin embargo no se sacaron las conclusiones necesarias.\nEn la actual pandemia muy pocos países han llevado adelante políticas consecuentes y consistentes con el objetivo de parar la transmisión del virus. En algunos casos motivados por la priorización de no enlentecer las actividades económicas. En otros casos a pesar de  expresarse la voluntad de actuar priorizando la salud\, la incapacidad ha limitado enormemente la obtención de resultados. Argentina está entre esos países. Por como fue el desarrollo de la pandemia\, Argentina al igual que los demás países latinoamericanos estaban en excelentes condiciones para pensar la estrategia a seguir\, así como para preparar la logística necesaria para su implementación. Argentina incluso tenía grandes ventajas comparativas por el gran desarrollo científico con que cuenta. Sin embargo\, luego de 11 meses de haberse detectado el primer brote de SAR-COV2 en China\, Argentina es uno de los países con peores números en cuanto a  cantidad de muertos e infectados\, así como en las consecuencias sociales y económicas. \nRealizar una análisis e intentar comprender porqué llegamos a esta situación parece ser esencial no solo para afrontar lo que queda por delante de la actual pandemia\, si no también para poder pensar cómo prepararnos para el futuro. \nJuan Flo es Biólogo especializado en inmunología y en biotecnología. Docente e investigador en la FCEyN (1979-2005). Desarrollo de  proyectos de sustentabilidad alimentaria para las poblaciones Wichi y Toba del oeste de la provincia de Formosa (1984-1985). Fue Secretario de prensa Conadu 1986-1990 y  Secretario Adjunto Conadu 1990-1991. Se dedica al desarrollo y producción de medicamentos biológicos (2005- actualidad) \nPodes ver todas las charlas acá
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SUMMARY:Los "temas" de la pandemia. Un análisis de los diálogos de lectores de medios nacionales.
DESCRIPTION:Los invitamos a la próxima charla del seminario a cargo de German Rosati\, de CONICET/UNSAM.\n\n\nQuien: German Rosati (CONICET/UNSAM)\n\n\nCuándo: Jueves 10/12 11AM\n\n\nLink zoom:  https://exactas-uba.zoom.us/j/94443673957\nTambién lo podes ver en youtube acá:\nhttps://www.youtube.com/channel/UCzcbeaNQEIhOFBRBdYx1NEA\n\n\n\n\nTítulo:  Los «temas» de la pandemia. Un análisis de los diálogos de lectores de medios nacionales.\nResumen: ¿Cuáles son los discursos que se producen alrededor de la pandemia? ¿Qué temas pueden detectarse? ¿De qué forma se entrecruzan con otras problemáticas? Se presentará un primer análisis de los diálogos y comentarios en foros de lectores de cinco diarios digitales de circulación nacional. Se trata de un primer ejercicio de aproximación a estas preguntas a partir de la aplicación de técnicas de modelado de tópicos. Asimismo\, se tratará de evaluar alcances y limitaciones de este tipo de fuentes de información. \nGermán Rosati (factor~data\, IDAES\, UNSAM / CONICET) \nGermán Rosati es sociólogo e investigador asistente del CONICET en el Instituto de Altos Estudios Sociales de la UNSAM. Allí coordina el laboratorio factor~data especializado en Ciencias Sociales Computacionales y se desempeña como docente. Sus temas de investigación se centran en la estructura social y agraria y la aplicación de técnicas de machine y procesamiento de lenguaje natural en las ciencias sociales. \nPodes ver todas las charlas acá
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SUMMARY:Defensa Tesis Licenciatura Gastón Brito
DESCRIPTION:Título:  Sobre la thinness en un grafo\nDirectora: Flavia Bonomo\nJurados: Luciano Grippo y Hernán Melgratti \nResumen:\nLa thinness de un grafo\, denida inicialmente en 2007\, es un invariante que generaliza a los grafos de intervalos. Todo grafo tiene un valor numerico de thinness y los grafos con thinness 1 coinciden con los grafos de intervalos.\nUn grafo es k-thin si sus vértices pueden ordenarse de manera que exista una partición de los vertices en k clases cumpliendo que para cada tripla de vertices r < s < t si r y s pertenecen a la misma clase y existe una arista entre r y t\, entonces existe una arista entre s y t. La thinness es el menor valor de k tal que el grafo sea k-thin.\nEn este trabajo denimos un modelo de intersección para los grafos con thinness y thinness propia menor o igual a 2 restringiendo los grafos con boxicity 2. Se caracterizan los grafos k-thin y k-thin propios utilizando propiedades de la matriz de adyacencia. Se acota la thinness en relacion al bandwidth de un grafo y se hace un resumen de las relaciones conocidas.\nSe calcula la thinness utilizando SAT Module Theory (SMT)\, tanto para determinar si vale la propiedad k-thin como para obtener el valor de la thinness mediante optimización. Se evalua la perfomance sobre familias de grafos con los resolvedores Z3 Theorem Solver y OptiMathSat. Adicionalmente se utilizan las mismas tecnicas para calcular una representación como una intersección de rectángulos en el plano. \nPalabras clave: Grafo\, Thinness\, Intervalo\, Boxicity\, Intersección\, Bandwidth\, SMT\, Z3
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SUMMARY:Modelos de Simulación para Escenarios de COVID-19 en Argentina
DESCRIPTION:Los invitamos a la próxima charla del seminario a cargo de Rodrigo Castro\, profesor en Exactas/UBA e investigador del Instituto UBA-CONICET de Ciencias de la Computación (ICC).\n\n\n\n\n\nQuien: Rodrigo Castro\, Exactas-UBA/ICC-CONICET\n\n\nCuándo: Jueves 17/12 11AM\n\n\nLink zoom:  https://exactas-uba.zoom.us/j/94443673957\nTambién lo podes ver en youtube acá:\nhttps://www.youtube.com/channel/UCzcbeaNQEIhOFBRBdYx1NEA\n\n\n\n\n\nTítulo: Modelos de Simulación para Escenarios de COVID-19 en Argentina \nResumen: La situación de la pandemia de COVID-19 en Argentina presenta enormes desafíos interdisciplinarios para varias ramas de la ciencia (naturales\, sociales\, exactas\, políticas\, etc.)\, demandando respuestas en el lapso más corto posible en un contexto de emergencia sanitaria y económica.\nLas preguntas clave a responder cambian al ritmo de la evolución de la pandemia y la reacción de la sociedad\, exigiendo análisis a varias escalas espaciales y temporales. En esta serie de charlas presentamos enfoques desde los modelos matemáticos\, la simulación computacional y la ciencia de datos aplicados a comprender la dinámica de la pandemia y proyectar posibles escenarios futuros. Los resultados forman parte de un proyecto interdisciplinario e interinstitucional en curso\, cuyo objetivo es ofrecer un menú herramientas de información para apoyar la toma de decisiones en políticas públicas basadas en evidencia. \nRodrigo Castro es Ingeniero Electrónico y Doctor en Ingeniería por la Universidad Nacional de Rosario. Realizó su posdoctorado en el Instituto Politécnico Federal Suizo\, ETH Zurich.\nEs Profesor Adjunto del Departamento de Computación de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales de la UBA e Investigador Adjunto del Instituto UBA-CONICET de Ciencias de la Computación\, donde es Secretario de Investigación y Director del Laboratorio de Simulación de Eventos Discretos.\nEs el Investigador Responsable del proyecto «Proyección de tendencias y evaluación de escenarios de intervención para la epidemia COVID-19 en Argentina mediante Modelado y Simulación Computacional» financiado por la Agencia Nacional de I+D+i. \n\nPodes ver todas las charlas acá
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SUMMARY:Defensa Tesis Licenciatura Axel Ariel Lew
DESCRIPTION:Título: «Geolocalización de pájaros mediante radiotelemetría y machine learning»\nDirector: Agustín Gravano\nJurados: Pablo Turjanski y Pablo Brusco\n\nResumen:\nEl campo de Inteligencia Artificial\, y en particular el Aprendizaje Automático\, es cada día más utilizado y tiene cada vez mayor adopción tanto en diferentes industrias como en investigaciones de diversas áreas. Se pueden encontrar usos en campos como medicina\, psiquiatría o finanzas\, donde su uso trae grandes beneficios. En esta tesis nos proponemos utilizar herramientas del área de aprendizaje automático para realizar un trabajo colaborativo con investigadores del área de biología\, quienes estudian el comportamiento del Tordo Pico Corto\, una especie de pájaro que tiene un comportamiento parasitario. A partir de radiotransmisores colocados en ejemplares de esta especie\, y de antenas colocadas en el área de estudio\, utilizaremos el aprendizaje automático para poder estimar la posición de estos y así realizar diferentes estudios y análisis sobre el comportamiento de los mismos. La hipótesis central que vamos a analizar sugiere que los pájaros de esta especie tienen un comportamiento social monógamo. A través de diferentes experimentos\, analizando el tiempo que cada pareja de pájaros pasan juntos\, y la distancia a la que se encuentran entre sí\, encontramos evidencia que sugiere que esta hipótesis es cierta.
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SUMMARY:Defensa Tesis Licenciatura Javier Minces Müller
DESCRIPTION:Título: Detección de relaciones en informes médicos escritos en español\n\nDirectora: Viviana Cotik\nJurados: Pablo Turjanski y Franco Luque\n\n\nResumen:\n\nLa detección automática de relaciones entre entidades nombradas es una tarea importante del procesamiento del lenguaje natural. En informes médicos\, en particular\, la extracción de relaciones es de suma utilidad. Permite\, entre otras cosas\, asociar de manera automática los hallazgos clínicos descriptos en el informe con el área del cuerpo en donde ocurrieron. Esto hace posible descubrir información\, que puede asistir en la toma de decisiones\, de manera mucho más rápida de lo que se haría mediante un análisis manual. \nCasi todos los métodos desarrollados para esta tarea están implementados para textos en idioma inglés. Estos incluyen métodos basados en reglas y en técnicas de aprendizaje automático. \nEn este trabajo se realizó extracción de relaciones entre entidades nombradas sobre informes de ecografías escritos en español. Estos tienen la dificultad adicional de ser de naturaleza informal. Para esto se propusieron tres métodos: uno basado en co-ocurrencia de entidades\, otro basado en reglas y finalmente uno basado en redes neuronales convolucionales. Para este último se entrenaron word embeddings en español para textos médicos. \nSe obtuvieron resultados alentadores para los últimos dos métodos\, siendo mejores aquellos basados en reglas (F1 0.88 y 0.87 respectivamente). Se observó que la distancia entre las entidades relacionadas influye en los resultados.
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SUMMARY:Defensa Tesis Licenciatura Agustina Ciraco
DESCRIPTION:Título: «Funciones de distancia para la clasificación de familias de proteínas»\nDirector: Pablo Turjanski\nCodirector: Diego Ferreiro\nJurados: Facundo Carrillo y Rodrigo Gonzalo Parra \nResumen:\nLas proteínas son grandes moléculas compuestas por cadenas de aminoácidos. Una posible abstracción de la estructura de una proteína es a través de una secuencia de caracteres\, donde cada aminoácido se corresponde con un caracter. Esta representación se corresponde con lo que se denomina estructura primaria de una proteína. \nEn la naturaleza\, existen ciertas proteínas que presentan patrones estructurales recurrentes en su estructura primaria. Estas macromoléculas pueden ser clasificadas de acuerdo al largo de la mínima unidad de repetición que las constituyen. Aquellas para las cuales sus patrones de repetición son cortos (menores o iguales a 5 aminoácidos)\, se denominan fibrilares; para cuyas repeticiones se componen de 6 a 60 aminoácidos se denominan repetitivas; y\, finalmente las restantes\, se denominan globulares. \nEn el presente trabajo abordamos el desafío de proponer una función de distancia entre familias de proteínas\, para su clasificación\, a partir de un subconjunto de sus patrones de repetición maximales (MRs). \nComo paso previo a la propuesta de una función de distancia\, propusimos la estructura de Trie para contener los prefijos de los MRs de las familias de las proteínas. Partiendo de esa estructura exploramos la posibilidad de utilizar algoritmos existentes dentro del campo de las redes de computadoras para la comparación de dichas estructuras. Los resultados obtenidos en esta dirección no fueron exitosos\, pues no pudimos encontrar un algoritmo que cumpliera con nuestros requerimientos. \nA partir del resultado anterior\, decidimos proponer una función propia de distancia entre familias de proteínas. Exploramos diversas alternativas\, siempre basadas en prefijos de MRs. A todas ellas las pusimos a prueba utilizando como caso de estudio más de 50 familias de proteínas naturales (repetitivas y globulares) y de control. Los resultados obtenidos nos permitieron\, en algunas casos\, discriminar entre familias de proteínas naturales y de control. Sin embargo\, no hemos podido hallar una función que permita agrupar\, por un lado familias de proteínas repetitivas\, y por el otro globulares. \nEn vista de los resultados obtenidos se puede considerar la posibilidad de que para lograr el objetivo de separar las familias de proteínas globulares de las repetitivas\, no alcance sólo con los patrones ya que los mismos quizás no posean suficiente información. Tal vez\, para poder distinguirlas falte\, a modo de ejemplo\, información acerca del código de plegado; o quizás sea necesario utilizar otra representación del alfabeto. Queda como línea futura de trabajo pensar alternativas para poder lograr incorporar nueva información.
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SUMMARY:Defensa Tesis Doctorado Lucio Santi
DESCRIPTION:Título: Nuevos Métodos Híbridos para Modelado y Simulación Eficiente de Partículas en Geometrías 3D\nDirector: Rodrigo Castro\nJurados:\n– Alfonso Urquía (Universidad Nacional de Educación a Distancia\, España)\n– Javier Quinteros (Helmholtz Centre Potsdam\, GeoForschungsZentrum\, Alemania)\n– Hernán P. Wahlberg (CONICET/Universidad Nacional de La Plata\, Argentina) \nLugar: Vía Zoom. Puede seguirse en vivo por youtube en https://youtu.be/tugOCmm67Rs?t=1 \nResumen: \nEl modelado y la simulación de dinámica de partículas son componentes esenciales en disciplinas diversas tales como la física de altas energías\, la dinámica de fluidos computacional o la computación gráfica\, entre otras. Una característica distintiva de la simulación de partículas es la necesidad de trazar sus trayectorias de forma continua a medida que se desplazan en una geometría\, identificando cuidadosamente en tiempo y espacio los cruces entre volúmenes adyacentes. A su vez\, cada dominio de aplicación suele adoptar metodologías de modelado propias que\, en su mayoría\, se apoyan en lenguajes de programación de propósito general que no fueron concebidos para el modelado matemático. \nEsta Tesis explora nuevas técnicas y metodologías de modelado y simulación de sistemas de partículas basadas en métodos numéricos híbridos (aquellos que combinan la solución de sistemas continuos con la representación de eventos discretos) y en un lenguaje de modelado orientado a ecuaciones que permite expresar dinámicas tanto continuas como discretas.\nPartiendo de la familia moderna de métodos Quantized State System (QSS) y sus implementaciones asociadas\, proponemos nuevas extensiones genéricas y rigurosas para describir sistemas de partículas en geometrías tridimensionales reticuladas basándonos en el lenguaje de modelado Modelica. \nLa naturaleza híbrida de nuestros algoritmos de simulación permite transformar un problema de tratamiento difícil en uno de solución trivial: la detección de cruces entre volúmenes puede transformarse de un problema de detección de eventos de estado en uno de detección de eventos temporales. Esto redunda en un tratamiento inherentemente eficiente de las discontinuidades que se producen -ante cada cruce de geometría- en las ecuaciones dinámicas de movimiento de las partículas. \nAdoptamos como campo aplicación testigo a la Física de Altas Energías (FAE). Las simulaciones en esta disciplina consisten en trazar las trayectorias de partículas subatómicas en su desplazamiento a lo largo de una geometría compleja\, que usualmente representa un detector de partículas. Apoyándonos en Geant4\, el simulador por excelencia de la comunidad FAE\, presentamos dos nuevas técnicas de simulación basadas en eventos discretos: GQLink\, un esquema de co-simulación en el cual el motor de integración numérica del simulador QSS Solver toma el control de los procesos de transporte de partículas\, y QSStepper\, un integrador numérico autónomo optimizado que opera en forma nativa como parte del ecosistema de integración numérica de Geant4. \nAmbas técnicas son rigurosamente analizadas en el marco de dos casos de estudio complementarios: un caso simple en el que un positrón describe trayectorias helicoidales en un reticulado de cubos\, y un caso realista que modela el detector Compact Muon Solenoid (CMS) que opera en el CERN (Organización Europea para la Investigación Nuclear). Luego establecemos una caracterización genérica para identificar otros escenarios potenciales en el contexto de la FAE donde nuestros métodos puedan proveer mejoras sustanciales en el desempeño de las simulaciones. \nAvanzando en la generalización de los métodos\, dotamos a QSS con la capacidad de interactuar con geometrías tridimensionales reticuladas arbitrarias\, surgiendo de este modo una nueva metodología genérica de modelado y simulación de sistemas de partículas que denominamos retQSS (QSS para geometrías reticuladas). Potenciamos las ventajas provistas por un lenguaje estandarizado de modelado basado en ecuaciones y mostramos diversos dominios de aplicación de retQSS que incluyen modelos de bandadas de pájaros con comportamiento emergente\, sistemas de moléculas con interacciones mediante campos de fuerza arbitrarios y modelos de flujo de plasma\, entre otros\, destacando la flexibilidad del enfoque y la elegancia y forma compacta de los modelos resultantes. \nAdicionalmente\, comentaremos brevemente una aplicación reciente de retQSS a simulación de agentes en procesos de contagio de COVID-19\, con foco en la interacción entre partículas y geometría. \nPalabras clave: Quantized State System\, Simulación de partículas\, Física de altas energías\, Modelica\, QSS Solver.
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SUMMARY:Defensa Tesis Licenciatura Luis Agustín Nieto
DESCRIPTION:Título: «Una red neuronal para la detección de exoplanetas en series temporales de velocidad radial»\nDirectores: Rodrigo F. Diaz (CONICET\, ICAS-UNSAM) y Enrique Carlos Segura (DC-UBA)\nJurados: Julio C. Jacobo Berlles (DC-UBA) y Francisco Grings (CONICET\, IAFE) \nResumen:\nEl estudio de planetas extrasolares es un campo de investigación relativamente nuevo. Hace apenas 25 años se confirmaba el descubrimiento del primer exoplaneta en torno a una estrella de tipo solar y\, gracias a las mejoras en instrumentos y técnicas\, este número de cuerpos celestes fue creciendo rápidamente utilizando\, principalmente\, los métodos de velocidad radial y tránsito. \nMisiones como GAIA y TESS; junto a otros proyectos\, como el relevo VVV o el LSST; están aportando una cantidad cada vez más grande de información astronómica y la comunidad está mirando hacia la ciencia de datos y a las diferentes técnicas de inteligencia artificial como un apoyo importante ante esta avalancha de información. \nEl método de velocidad radial busca detectar la presencia planetaria mediante caracterizaciones de los movimientos de su estrella central; los diferentes ruidos provocados por la variabilidad intrínseca de la estrella; sumados al error instrumental y variabilidad temporal en la toma de datos\, pueden dificultar la interpretación de los mismos e incluso generar falsas detecciones. \nEn este trabajo se propone una red neuronal que reemplaza un cálculo crucial de este método\, se generan señales estelares sintéticas de estrellas de tipo solar y se comparan las aplicaciones de ambas implementaciones.\nLa red alcanza un 28% menos de falsos positivos en la detección de planetas y presenta una mejora sustancial en el tiempo de ejecución de cinco órdenes de magnitud\, haciéndola ideal para su aplicación en grandes volúmenes de datos.
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SUMMARY:Defensa Tesis Doctorado Matías Marino
DESCRIPTION:Título: Modelos computacionales para tratamientos oncológicos basados en electroporación\nDirector: Guillermo Marshall\nConsejero de estudios: Esteban Mocskos\nJurados:\nMario Storti\, Universidad Nacional del Litoral-CONICET\nSergio Zlotnik\, Universidad Politécnica de Cataluña\nAlejandro Otero\, Facultad de Ingeniería\, UBA-CONICET \nResumen: \nUno de los grandes desafíos científicos en la lucha contra el cáncer es la búsqueda de soluciones más económicas y con menos efectos secundarios adversos. En este contexto\, surge un grupo de terapias alternativas basadas en la electroporación (EP). La EP es un fenómeno físico en el cual la aplicación de pulsos eléctricos sobre una célula causa un incremento en la permeabilidad de la membrana que la recubre. De este modo\, pueden ingresar a la célula moléculas que en condiciones normales no lo harían. Existen numerosas aplicaciones en diversas áreas de la ciencia y la tecnología basadas en la EP\, como la medicina\, la biotecnología\, el procesamiento de alimentos y el medio ambiente\, entre otras. En medicina\, las más utilizadas son la Electroquimioterapia (ECT)\, la Electrotransferencia Génica (GET) y la Electroporación Irreversible (IRE). \nEl objetivo de esta tesis es el estudio y optimización de tratamientos basados en EP a través de modelos matemáticos y computacionales y su validación experimental. \nLa aplicación de un campo eléctrico sobre un tejido en un tratamiento GET\, genera efectos secundarios no deseados tales como los frentes de pH inducidos por el fenómeno de electrólisis subyacente. Para contrarrestar este efecto se estudia un fenómeno no tenido en cuenta hasta ahora en la literatura especializada: la neutralización del pH por el sistema buffer del tejido. Para ello\, se formula un modelo matemático-computacional que describe el transporte iónico con la ecuación de Nernst-Planck sujeta a la condición de electroneutralidad y a las condiciones de Butler-Volmer en los bordes del dominio. Los resultados muestran que independientemente de la presencia del buffer\, los frentes de pH permanecen durante varios minutos en un estado no fisiológico sugiriendo posibles daños al plásmido durante un tratamiento GET. \nEn esta tesis\, también se introduce OpenEP\, un simulador de protocolos de electroporación específico para tratamientos basados en EP que se distribuye bajo una licencia de software libre. OpenEP tiene como objetivo proporcionar a la comunidad académica una implementación flexible para predecir la evolución y optimización de varios protocolos basados en EP. La implementación tridimensional altamente eficiente se obtiene mediante el uso de C++ y OpenMP en un entorno GNU / Linux. Los resultados muestran que OpenEP facilita la predicción de un óptimo EP basado en un protocolo\, como ECT o GET\, definido como la dosis de pulso crítica que produce el máximo tejido electroporado con un daño mínimo. \nEn la búsqueda de un método de optimización para protocolos basados en EP en términos del número de pulsos\, considerando el daño en el tiempo\, se propone la combinación de dos modelos: el tejido como un conductor iónico para el cálculo del daño\, y el tejido como un conductor eléctrico para el cálculo del volumen electroporado. Los modelos se basan en la ecuación de Nernst-Planck y de Laplace-Pennes\, respectivamente. Los resultados muestran que existe una relación de dosis-respuesta óptima en un protocolo GET\, que consiste en la dosis de pulso crítica que produce el máximo volumen de tejido electroporado con daño mínimo inducido por frentes de pH. Dado a que el daño inducido por pH es proporcional a la dosis de Coulomb\, el daño inducido por frentes de pH es despreciable en tratamientos típicos de tumores basados en EP\, como en la ECT e IRE\, pero no en GET\, debido a los pulsos más largos aplicados\, es decir\, mayor dosis aplicada. \nSe espera que los resultados de esta tesis permitan optimizar las terapias basadas en electroporación de manera tal de generar planes de tratamiento más eficaces y con menores efectos adversos y costos económicos. Se desea\, en última instancia\, que este trabajo contribuya a mejorar la calidad de vida de los pacientes. \nEsta tesis está basada principalmente en los siguientes trabajos: \npH fronts and tissue natural buffer interaction in gene electrotransfer protocols\, M. Marino\, N. Olaiz\, E. Signori\, F. Maglietti\, C. Suárez\, S. Michinski\, G. Marshall\, Electrochimica Acta 255 (Supplement C) (2017). \nTowards an optimal dose-response relationship in gene electrotransfer protocols\, E. Luján\, M. Marino\, N. Olaiz\, G. Marshall\, Electrochimica Acta 319 (2019) \nThe role of damage in reversible electroporation optimization: theory and experiments in a vegetable model\, M. Marino\, N. Olaiz\, F. Maglietti\, S. Michinski\, P. Giunta\, et al.\, 3rd World Congress on Electroporation and Pulsed Electric Fields in Biology\, Medicine\, and Food & Environmental Technologies (2019) Toulouse\, France. \nOpenEP: an open-source simulator for Electroporation-based Tumor Treatments\, M. Marino\, E. Luján\, E. Mocskos\, G. Marshall\, Scientific Reports\, Nature (2020) en prensa.
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SUMMARY:Defensa Tesis Licenciatura Franco Frizzo
DESCRIPTION:Titulo: “Secuencias maravillosas anidadas»\nDirectora:   Verónica Becher\nJurados:   Sergio Abriola y  Flavia Bonomo \nAula Zoom: https://zoom.us/my/dc.aula10\nClave del Aula Zoom: G.Hopper \nResumen: Consideremos un alfabeto de b símbolos; las secuencias maravillosas de orden (n\,m) son secuencias de símbolos tomados de este alfabeto tales que\, al ser miradas circularmente\, todas las secuencias de longitud n aparecen exactamente m veces. Las secuencias maravillosas anidadas de orden (n\,m) son secuencias maravillosas que son a su vez la concatenación de b secuencias maravillosas anidadas de orden (n-1\, m)\, salvo que n = 1. \nSe sabe que siempre que n es menor o igual que m existen las secuencias maravillosas anidadas que cumplen que todas las secuencias de longitud n ocurren en distintas posiciones módulo m. ¿Es necesaria esta condición? Dicho de otro modo\, ¿Aparecen nuevas secuencias maravillosas anidadas de orden (n\,m) si se elimina la restricción de que las ocurrencias sean en distintas posiciones módulo m? \nEn esta tesis demostramos que para toda pareja n\, m con m exponencial con respecto a n la respuesta es afirmativa\, y presentamos un método de construcción. Además\, para un alfabeto de dos símbolos\, demostramos si n es mayor que 2m no existen tales secuencias. Conjeturamos que\, para todo n menor o igual que m + 1\, las secuencias existen y presentamos algunos ejemplos. Por último\, demostramos que utilizando secuencias maravillosas anidadas se puede construir números normales en el sentido de Borel cuya velocidad de convergencia a la normalidad es la máxima conocida hasta ahora.
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